Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RngttO55236 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RngttO55236 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RngttO55236 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RngttO55236 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RngttO55236 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RngttO55236 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RngttO55236 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RngttO55236 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RngttO55236 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RngttO55236 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RngttO55236 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RngttO55236 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RngttO55236 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RngttO55236 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RngttO55236 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RngttO55236 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RngttO55236 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RngttO55236 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RngttO55236 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RngttO55236 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms