Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChkbO55229 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChkbO55229 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChkbO55229 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms