Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dsg2O55111 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dsg2O55111 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms