Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms