Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlkO54988 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlkO54988 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlkO54988 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlkO54988 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlkO54988 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms