Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms