Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms