Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
DffbO54788 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DffbO54788 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DffbO54788 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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