Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfibp2O35711 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppfibp2O35711 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms