Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a2O35488 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Slc27a2O35488 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Slc27a2O35488 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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