Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Length 4,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TnxbO35452 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TnxbO35452 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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