Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrt1O35449 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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