Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna3O35344 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms