Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ArxO35085 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ArxO35085 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ArxO35085 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ArxO35085 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ArxO35085 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ArxO35085 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ArxO35085 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms