Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EllO08856 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EllO08856 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EllO08856 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EllO08856 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EllO08856 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EllO08856 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EllO08856 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EllO08856 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms