Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms