Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sec22bO08547 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec22bO08547 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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