Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm4312K9J7E2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms