Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8356J3QPD3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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