Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfsd4b4J3QNS5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms