Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c2J3QNM1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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