Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms