Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc180J3QNE4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms