Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20918J3QN17 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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