Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm3336J3QMQ6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm3336J3QMQ6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm3336J3QMQ6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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