Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm3727J3QM54 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm3727J3QM54 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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