Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20828J3KMI7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20828J3KMI7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm20828J3KMI7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm20828J3KMI7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm20828J3KMI7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20828J3KMI7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm20828J3KMI7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm20828J3KMI7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm20828J3KMI7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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