Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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