Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms