Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgxb3G3X9M3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms