Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms