Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms