Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3371F7CQW8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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