Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3443F7CCV5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms