Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Crocc2F6XLV1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms