Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21876F6XK35 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21876F6XK35 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21876F6XK35 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm21876F6XK35 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21876F6XK35 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21876F6XK35 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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