Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms