Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm17555F6U8B9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm17555F6U8B9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17555F6U8B9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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