Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Herc6F2Z461 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms