Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Taf4E9QAP7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Taf4E9QAP7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Taf4E9QAP7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Taf4E9QAP7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Taf4E9QAP7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Taf4E9QAP7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Taf4E9QAP7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Taf4E9QAP7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms