Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd7E9Q9W7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms