Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms