Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc121E9Q6D3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc121E9Q6D3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms