Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20518E9Q548 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20518E9Q548 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm20518E9Q548 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm20518E9Q548 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm20518E9Q548 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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