Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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