Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Pdzd2E9Q1M1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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