Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms