Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt78E9Q0F0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms