Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms