Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc1E9Q043 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms